تأسّس اتحاد جامعات العالم الإسلامي في إطار المنظمة الإسلامية للتربية والعلوم والثقافة -إيسيسكو، بتوصية من اللجنة الدائمة للتعاون العلمي والتكنولوجي التابعة لمنظمة التعاون الإسلامي.
عقد المؤتمر التأسيسي لاتحاد جامعات العالم الإسلامي في الفترة من 30/11 - 1/12 سنة 1987 في مدينة الرباط بالمملكة المغربية. ونصَّ النظام الأساس للاتحاد حينها، على أن يكون مقرّه الدائم في الإدارة العامة للمنظمة الإسلامية.
يتمتع اتحاد جامعات العالم الإسلامي بشخصية اعتبارية مستقلة؛ ويضم كافة الجامعات الحكومية والأهلية في العالم الإسلامي. كما يرتبط الاتحاد بالمنظمة الإسلامية "إيسيسكو" بما يتفق مع الأهداف المنصوص عليها في ميثاق الاتحاد. حيث تعتبر المنظمة الجهاز الإسلامي الدولي المتخصص في التربية والعلوم والثقافة ويقع في صميم اختصاصاتها كل ما يتعلق بأمور التعليم عموماً على صعيد العالم الإسلامي؛ تخطيطاً وتنظيراً وتنسيقاً.
أهداف اتحاد جامعات العالم الإسلامي
• رفع مستوى البحوث العلمية في كافة المجالات، وتبادل نتائجها وربطها بالمتطلبات التنموية والحضارية للأمة الإسلامية
• رفع مستوى التعليم العالي وتطويره استجابة لاحتياجات المجتمعات الإسلامية واستفادة من المستجدات العلمية والتكنولوجية في إطار الثوابت الحضارية للأمة الإسلامية
• تقوية التعاون بما يعزز تبادل التجارب والدراسات والبرامج والزيارات في مجال التربية والعلوم والثقافة والتكنولوجيا
• تشجيع تدريس لغة القرآن الكريم والثقافة الإسلامية في الجامعات الأعضاء
• دعم جهود مؤسسات التعليم العالي لمعالجة قضايا العصر وترسيخ قيم التفاهم والتعايش والسلام بين شعوب الأمة الإسلامية والعالم أجمع
• الارتقاء بالقدرات البشرية والمعرفية للجامعات الأعضاء
• العناية بالتراث الإسلامي، تعريفاً وترجمةً وتحقيقاً، وإبراز إسهام علمائه في البناء الحضاري الإنساني.
