يهدف برنامج الدكتوراة في علم الحاسوب إلى إغناء الباحثين الفلسطينيين بمعرفة متقدمة وتنافسية في مجال علم الحاسوب، وتزويدهم بمهارات البحث العلمي ذات العلاقة. إضافةً إلى ذلك، يهدف البرنامج إلى إعداد خريجين قادرين على تطوير حلول جديدة ومبتكرة في مجالي الذكاء الاصطناعي وأنظمة البرمجيات، وكذلك تطوير حلول وتطبيقات جديدة بغرض سد حاجات محلية وإقليمية. جنباً إلى جنب، يسعى البرنامج أيضاً إلى إغناء السوق الفلسطينية بمهارات جديدة في البحث والتطوير للتمكن من صنع قرارات ووضع سياسات مبنية على المعرفة