تقلد د. خليل هندي منصب رئيس جامعة بيرزيت خمس سنوات خلال الفترة بين 2010 و2015.

عمل من (2008- 2010) عميداً مشاركاً وأستاذاً لعلم الإدارة في كلية سليمان العليان لإدارة الأعمال في الجامعة الأميركية ببيروت. وكان منذ (2002 - 2008 ) في الجامعة نفسها أستاذًا للإدارة الهندسية في كلية الهندسة وأستاذًا للعلوم الإدارية في كلية إدارة الأعمال. وقبل ذلك، تقلد مناصب أكاديمية عديدة في جامعات إنجلترا.

يحمل د. هندي بكالوريوس وماجستير ودكتوراة في الهندسة الكهربائية من جامعة مانشستر، ودكتوراة عليا في العلوم الإدارية. وهو مهندس مرخص ورياضي مرخص في بريطانيا. كان زميلاً في الجمعيات العلمية البريطانية التالية: جمعية المهندسين الكهربائيين، وجمعية الكمبيوتر، وجمعية الرياضيات وتطبيقاتها، والجمعية الملكية للفنون. ونفّذ، عندما كان في بريطانيا، أعمالاً استشارية لعدد من الشركات الكبرى.

نشر ما يزيد على 60 ورقة بحثية في الهندسة وعلوم الإدارة في مجلات دولية رفيعة.